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    焦點熱文:我科學家率先繪就家蠶超級泛基因組圖譜

    時間:2022-10-12 15:45:01       來源:光明網-《光明日報》


    【資料圖】

    光明日報重慶10月10日電(記者李宏、張國圣)西南大學近日發布最新研究成果:家蠶基因組生物學國家重點實驗室主任、國家蠶桑產業技術體系首席科學家代方銀教授團隊完成家蠶大規模種質資源基因組解析(“千蠶基因組”),在全球首次繪就家蠶超級泛基因組圖譜,并率先實現了家蠶這個物種遺傳信息的數字化——“數字家蠶”。

    家蠶是重要的經濟昆蟲和新興模式生物,之前僅有單一參考基因組及部分重測序,不足以支撐基因組變異和優良基因的深度挖掘,尤其對于分子育種具有顯著局限。而超級泛基因組是一個物種所有基因組信息的總和,對于深化功能基因組研究、種質創新等意義重大。

    “家蠶超級泛基因組圖譜是涵蓋了蠶的所有遺傳信息的一張圖,通過這張圖我們可以直接對接表型和基因組密碼?!贝姐y打比方說,以前鑒定特定性狀的基因或其因果變異猶如“大海撈針”,現在可謂是“甕中捉鱉”,因為超級泛基因組為此提供了“精細網格化”的“坐標”指導,對于行家里手來說像是“查字典”。

    據西南大學家蠶基因組生物學國家重點實驗室教授、博士生導師童曉玲介紹,研究團隊對1078份蠶種質資源進行了測序,其中包括47個野桑蠶、205個家蠶地方種、194個實用種和632個突變體,繪制出了一個高精度家蠶泛基因組圖譜。該超級泛基因組囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息,是迄今全球動植物領域最大的長讀長泛基因組。同時,團隊還對蠶的各種遺傳變異、群體結構、人工選擇和生態適應性及經濟性狀開展了深入的研究,取得了豐碩的創新結果。

    家蠶起源于我國,由中國古野桑蠶馴化而來,具有5000多年的馴養歷史,但其馴化起源地是長期懸而未決的問題,特別是缺乏有力的生物學證據。本研究的材料呈現了來自全球各主要養蠶地區的最豐富的遺傳多樣性,研究發現黃河中下游地區的地方種分布在進化樹上家蠶分支的基部,表明家蠶起源于黃河中下游地區。

    《光明日報》( 2022年10月11日?09版)

    標簽: 基因組圖譜

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